Las políticas nacionales inciden de forma crítica en los resultados de producción y comunicación científica que experimentan en la actualidad los países latinoamericanos. Estos países están en un momento de desarrollo y adaptación a los esquemas de evaluación y calidad que existen en otros países más avanzados en el campo de la ciencia. Las condiciones políticas y económicas de esta región latinoamericana han sido favorables en el último lustro, aunque pocos de estos países han aprovechado este momento. En este trabajo se analizan las diferentes políticas públicas de ciencia que se implementan en dos países latinoamericanos, Colombia y Ecuador, para estimular la producción científica y potenciar el ecosistema integral de investigación de cada uno de esos dos país. La conclusiones se centran, principalmente, sobre las diferencias detectadas en sus respectivas políticas de inversión, sus sistemas educativos superiores, y el volumen y la calidad de su producción científica.