Abstract:
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La publicación de la primera estructura cristalográfica de resolución atómica de un
miembro de la familia de los receptores acoplados a proteínas G (GPCR) como es la Rodopsina Bovina
(Rho) (1)marcó el comienzo de los estudios sobre la relación entre la actividad biológica y la
estructura de estas proteínas (1,2). Si bien se han llevado a cabo numerosos estudios de difracción
de rayos X de las estructuras de GPCRs desde ese momento, dada la dificultad de cristalización de
este tipo de proteínas, aun no se dispone hoy en día de la estructura tridimensional a nivel
atómico de un gran número de GPCRs, entre ellos del receptor de Neuroquinina (NK1-R). Sin embargo,
dado que los GPCRs comparten una estructura de 7 hélices de transmembrana enlazadas por loops se
han podido producir modelos de diferentes receptores de membrana por homología de secuencia (2; 3;
4).
El receptor NKI-R está involucrado en muchos eventos celulares de inflamación, dolor, trastornos
neuronales, del sistema digestivo y del sistema inmune, incluyendo cáncer (4), un modelo 3D de este
receptor puede ser utilizado para conocer con más detalle los principios básicos moleculares de su
actividad biológica y ser utilizado en el diseño racional de fármacos. En el presente trabajo se ha
obtenido un modelo del receptor NK1R mediante modelización por homología de secuencia (HM) y
dinámica molecular (DM), utilizando la estructura 3D de alta resolución (1.8 Å) del receptor
delta-opioide presentado el 2014. El modelo final fue utilizado para el anclaje de cinco
antagonistas no peptídicos, confirmando las interacciones con ciertos residuos presentes en el
sitio activo, en concordancia con estudios de mutagénesis dirigida. Estos resultados han permitido
definir un farmacóforo 3D que cumplió con al menos dos puntos, al evaluar el docking con 5
diferentes antagonistas no peptídicos, conocidos por su eficacia terapéutica y su alta afinidad por
el receptor.
El modelo refinado del receptor NK1-R sugiere algunos residuos claves en el sitio de unión, de los
cuales no se tiene referencia en estudios previos de mutagénesis dirigida,
así mismo el farmacóforo obtenido presenta características útiles para el diseño racional de fármacos esto puede significar nuevos retos para futuras investigaciones.
Los resultados y conclusiones obtenidos se detallan en las secciones respectivas del
presente informe. |