En la década de los 90 se descubrió un nuevo sistema de comunicación célula-célula, que consiste en la liberación de vesículas cargadas con partículas bioactivas (proteínas, mRNA, miRNA, metabolitos, etc.) en el espacio extracelular. Este tipo de comunicación se ha conservado durante la evolución, hecho que justificaría que la mayoría de los tipos celulares puedan generarlas. Estas vesículas extracelulares (VE) pueden regular diversos procesos fisiológicos, así como el desarrollo y progresión de enfermedades. En los últimos anos se ha extendido el estudio de las VE generadas principalmente por células madre adultas o embrionarias, células sanguíneas, células del sistema inmune y nervioso, así como células tumorales. El análisis de VE en fluidos corporales ha sido utilizado como herramienta de diagnóstico en cáncer y recientemente para distintas enfermedades renales. Sin embargo, en esta revisión pretendemos analizar la importancia, función y posible aplicación clínica de las VE generadas por células madre en enfermedades renales y en trasplantes.