Mesopelagic fishes experience an extreme body transformation from larvae to adults. The identification of the larval stages of fishes from the two orders Myctophiformes and Stomiiformes is currently based on the comparison of morphological, pigmentary and meristic characteristics of different developmental stages. However, no molecular evidence to confirm the identity of the larvae of these mesopelagic species is available so far. Since DNA barcoding emerged as an accurate procedure for species discrimination and larval identification, we have used the cytochrome c oxidase 1 or the mitochondrial 12S ribosomal DNA regions to identify larvae and adults of the most frequent and abundant species of myctophiforms (family Myctophidae) and stomiiforms (families Gonostomatidae, Sternoptychidae and Phosichthyidae) from the Mediterranean Sea. The comparisons of sequences from larval and adult stages corroborated the value of the morphological characters that were used for taxonomic classification. The combination of the sequences obtained in this study and those of related species from GenBank was used to discuss the consistency of monophyletic clades for different genera. Pairwise nucleotide distances were notably higher inter- than intraspecifically, and were useful to discern between congeners such as Cyclothone braueri and C. pygmaea, Hygophum benoiti and H. hygomii, Lampanyctus crocodilus and L. pusillus, and Notoscopelus bolini and N. elongatus

Los peces mesopelágicos experimentan una transformación radical desde las fases larvarias hasta que alcanzan el estado adulto. La identificación de las fases larvarias de peces procedentes de los órdenes Myctophiformes y Stomiiformes se basa actualmente en la comparación de caracteres morfológicos, de pigmentación y merísticos entre diferentes estados de desarrollo. El objetivo de este estudio consistió en demostrar la existencia de evidencias genéticas que confirmen la identificación correcta de las larvas de estas especies de peces mesopelágicos en base a la clásica clasificación morfológica. Las regiones de ADN mitocondrial correspondientes al gen citocromo oxidasa 1, o alternativamente, el gen que codifica la subunidad 12S del rARN, fueron secuenciadas parcialmente, tras lo cual se aplicó el procedimiento “DNA barcoding” para la identificación de larvas y adultos de las especies más abundantes y frecuentes de Myctophiformes (Familia Myctophidae) y Stomiiformes (Familia Gonostomatidae, Sternoptichydae y Phosychthiydae) del Mediterráneo. Las comparaciones por pares de las secuencias de larvas y adultos corroboraron el valor de los caracteres morfológicos utilizados en las clasificaciones taxonómicas. Dichas secuencias en combinación con otras secuencias de las mismas especies, o géneros, obtenidas a partir de GenkBank, permitieron discutir la solidez de grupos monofiléticos para diversos géneros. Las distancias nucleotídicas entre pares de secuencias fueron considerablemente superiores a nivel interespecífico que intraspecífico, y permitieron discernir entre congéneres tales como Cyclothone braueri y C. pygmaea, Hygophum benoiti e H. hygomii, Lampanyctus crocodilus y L. pusillus, y Notoscopelus bolini y N. elongatus