Aquest document parteix del reconeixement del principi d'autonomia de les persones i de la llibertat de consciència, ideològica i religiosa. I precisament per això exposa el risc que, en la pràctica sanitària, l'exercici de l'objecció de consciència pugui fer col·lisió amb els drets dels usuaris. Per aquesta raó, l'Administració i les diverses institucions involucrades, han de prendre les mesures necessàries per facilitar la compatibilitat de l'exercici dels drets i les decisions de totes les persones implicades.