Different Mutational Profiles of Subcutaneous Panniculitis-like T-cell Lymphoma and Lupus Panniculitis: An Additional Case Series

Abstract

Linfoma de células T tipo paniculitis subcutánea; Lupus-paniculitis; Secuenciación de próxima generación

Subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma; Lupus panniculitis; Next-generation sequencing

Limfoma de cèl·lules T tipus paniculitis subcutània; Lupus-paniculitis; Seqüenciació de pròxima generació

Background Subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma (SPTCL) is a rare cytotoxic T-cell lymphoma with indolent behavior, mostly present in women and associated with immunological diseases whose pathogenic background is still poorly understood. SPTCL is associated with lupus erythematosus panniculitis (LEP) and histologically misdiagnosed. Objectives The aim of our study was to identify mutations affecting the pathogenesis of both SPTCL and LEP. Materials and methods We studied a total of 10 SPTCL and 10 LEP patients using targeted next-generation sequencing and pyrosequencing. Differences in gene expression between molecular subgroups were investigated using NanoString technology. Clinical data were collected, and correlations sought with the molecular data obtained. Results The mutational profile of SPTCL and LEP is different. We identified fewer pathogenic mutations than previously reported in SPTCL, noting a single HAVCR2-mutated SPTCL case. Interestingly, 40% of our SPTCL cases showed the pathogenic TP53 (p.Pro72Arg) (P72R) variant. Although cases showing HAVCR2 mutations or the TP53 (P72R) variant had more severe symptomatic disease, none developed hemophagocytic syndrome (HPS). Furthermore, TP53 (P72R)-positive cases were characterized by a lower metabolic signaling pathway and higher levels of CD28 expression and Treg signaling genes. In addition, 30% of our cases featured the same mutation (T735C) of the epigenetic modificatory gene DNMT3A. None of the LEP cases showed mutations in any of the studied genes. Conclusions The mutational landscape of SPTCL is broader than previously anticipated. We describe, for the first time, the involvement of the TP53 (P72R) pathogenic variant in this subgroup of tumors, consider the possible role of different genetic backgrounds in the development of SPTCL, and conclude that LEP does not follow the same pathogenic pathway as SPTCL.

Introducción El linfoma T paniculítico (LTP) es un linfoma de células T citotóxico poco frecuente, de comportamiento indolente, más frecuente en mujeres, relacionado con enfermedades autoinmunes, y cuyos antecedentes patogénicos aún no se conocen bien. Se asocia y se confunde histológicamente con la paniculitis lúpica (PL). Objetivos El objetivo de nuestro estudio fue identificar mutaciones implicadas en la patogénesis del LTP y de la PL. Materiales y métodos Se estudiaron 10 pacientes con LTP y 10 con PL mediante secuenciación masiva (con un panel de genes customizados) y pirosecuenciación dirigida. Se investigaron diferencias en la expresión genética mediante NanoString entre diferentes subgrupos moleculares encontrados. Se recopilaron datos clínicos y se correlacionaron con los datos moleculares obtenidos. Resultados El perfil mutacional del LTP y el de la LP son diferentes. El porcentaje de mutaciones encontradas en el subgrupo de LTP fue inferior al ya publicado en la literatura. Solo un paciente con LTP mostraba mutaciones en el gen HAVCR2. Curiosamente, el 40% de los LTP mostraron la variante patogénica TP53 (p.Pro72Arg) (P72R). Los pacientes con mutaciones en el gen HAVCR2 o con la variante TP53 (P72R) sufrían enfermedad sintomática, aunque ninguno desarrolló síndrome hemofagocítico (SPH). El estudio de NanoString identificó que las muestras con alteración de TP53 (P72R) se caracterizaban por una down-regulation de la vía de señalización del metabolismo y de una mayor expresión de los genes de las vías de señalización de CD28 y Treg si se comparaban con los casos negativos para TP53 (P72R). Además, el 30% de nuestros casos presentaban la misma mutación (T735C) en el gen modificador epigenético DNMT3A. Ninguno de los pacientes con PL mostró mutaciones en ninguno de los genes estudiados. Conclusiones Ampliamos el perfil mutacional del LTP, describiendo por primera vez la implicación de la variante patogénica TP53 (P72R) en este subgrupo de tumores. Además, sugerimos el posible papel de un fondo genético en el desarrollo de los LTP. La aparición de PL no parece seguir la misma vía patogénica que la de los LTP.

This work was supported by grants from the Instituto de Salud Carlos III, from the Ministry of Science and Innovation of Spain, PI17/2172; ISCIII-MINECO-AES-FEDER. R.A.-A. is the recipient of PFIS predoctoral fellowship. L.T.-R. is funded by Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowship (No. 882597). M.R.-M. is supported by CIBERONC (CB16/12/00291). P.M. has a Miguel Servet contract funded by the ISCIII (CP16/00116). L.d.l.F. was supported by the ISCIII contract CA18/00017.