Para acceder a los documentos con el texto completo, por favor, siga el siguiente enlace: http://hdl.handle.net/2117/14481

Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas
Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre
Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial; Universitat Politècnica de Catalunya. SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics
En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de explotar, estructurar y organizar esta información para poder sacar partido de ella. Sin embargo, a día de hoy no existe ninguna aplicación que caracterice el entorno en el que una proteína o conjunto de proteínas actúa. En este trabajo se ha desarrollado un paquete de software que consulta, de forma masiva, bases de datos publicas, como Gene Ontology Annotation (GOA) y Human Proteome Resource Database (HPRD) y presenta la información en ellas contenida de forma que pueda ser fácil y rápidamente interpretada por personas pertenecientes al entorno clínico y no familiarizadas con el uso de bases de datos. Para ello presenta al usuario un conjunto de grupos de proteínas que forman parte del entorno de interacción local del conjunto inicial de proteínas y que forman subredes de alta conectividad. Además describe con etiquetas semánticas los aspectos particulares de cada grupo.
Peer Reviewed
-Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
-Genes -- Diseases -- Mathematical models
-Gens -- Malalties -- Models matemàtics
Artículo - Borrador
Objeto de conferencia
UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID
         

Mostrar el registro completo del ítem

Documentos relacionados

Otros documentos del mismo autor/a

Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre
Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Padró Capmany, Teresa; Badimón, Lina; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre
Pairó Castiñeira, Erola; Maynou Fernández, Joan; Vallverdú Ferrer, Montserrat; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Marco Colás, Santiago; Perera Lluna, Alexandre
Maynou Fernández, Joan; Vallverdú Ferrer, Montserrat; Clarià Sancho, Francesc; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre