Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas

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dc.contributor	Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial
dc.contributor	Universitat Politècnica de Catalunya. SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics
dc.contributor.author	Massanet Vila, Raimon
dc.contributor.author	Gallardo Chacón, Joan Josep
dc.contributor.author	Caminal Magrans, Pere
dc.contributor.author	Perera Lluna, Alexandre
dc.date	2010
dc.identifier.citation	Massanet-Vila, R. [et al.]. Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas. A: Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica. "Libro de Actas del XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010)". Madrid: UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID, 2010, p. 1-6.
dc.identifier.citation	978-84-8058-1
dc.identifier.citation	M-49430-2010
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/2117/14481
dc.language.iso	spa
dc.publisher	UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID
dc.relation	http://cataleg.upc.edu/record=b1304479~S1*cat
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject	Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
dc.subject	Genes -- Diseases -- Mathematical models
dc.subject	Gens -- Malalties -- Models matemàtics
dc.title	Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas
dc.type	info:eu-repo/semantics/draft
dc.type	info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.description.abstract	En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de explotar, estructurar y organizar esta información para poder sacar partido de ella. Sin embargo, a día de hoy no existe ninguna aplicación que caracterice el entorno en el que una proteína o conjunto de proteínas actúa. En este trabajo se ha desarrollado un paquete de software que consulta, de forma masiva, bases de datos publicas, como Gene Ontology Annotation (GOA) y Human Proteome Resource Database (HPRD) y presenta la información en ellas contenida de forma que pueda ser fácil y rápidamente interpretada por personas pertenecientes al entorno clínico y no familiarizadas con el uso de bases de datos. Para ello presenta al usuario un conjunto de grupos de proteínas que forman parte del entorno de interacción local del conjunto inicial de proteínas y que forman subredes de alta conectividad. Además describe con etiquetas semánticas los aspectos particulares de cada grupo.
dc.description.abstract	Peer Reviewed

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