Integrative analysis of single-cell and spatial transcriptomics characterizes the tumor microenvironment in HGSOC patients

dc.contributor.author
Cervilla García, Sergi
dc.date.issued
2022-12-05T13:38:10Z
dc.date.issued
2022-12-05T13:38:10Z
dc.date.issued
2022-06-21
dc.identifier
http://hdl.handle.net/10230/55087
dc.description.abstract
Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2021-2022
dc.description.abstract
Tutors: Eduard Porta Pardo i Mireia Olivella
dc.description.abstract
El microambient tumoral té un rol clau en la iniciació i progressió del càncer d’ovari serós d’alt grau. Per aquesta raó, la seva caracterització podria incrementar el nostre coneixement de la malaltia i el desenvolupament de nous tractaments que finalment millorarien la resposta dels pacients. Presentem un nou anàlisis basat en les dades que integra transcriptòmica espacial i de cèl·lules individuals que descriu l’estructura i les interaccions entre cèl·lules canceroses i les cèl·lules que constitueixen el microambient tumoral en pacients no tractats i tractats amb quimioteràpia.
dc.description.abstract
El microambiente tumoral tiene un rol clave en la iniciación y progresión del cáncer de ovario seroso de alto grado. Por esta razón, su caracterización podría incrementar nuestro conocimiento de la enfermedad y el desarrollo de nuevos tratamientos que por fin mejorarían la respuesta de los pacientes. Presentamos un análisis basados en datos que integra transcriptómica espacial y de células individuales que describen la estructura y las interacciones entre células cancerosas y las células que constituyen el microambiente tumoral en pacientes no tratados y tratados con quimioterapia
dc.description.abstract
The tumor microenvironment (TME) plays a key role in the initiation and progression of High Grade Serous Ovarian Cancer. For this reason, its characterization would increase our understanding of this disease and the development of new targeted treatments, eventually improving the outcome of patients. We present a novel data-driven analysis that integrates spatial transcriptomics and single-cell data to characterize the structure and the interaction between cancer cells and the cells populating the TME in non-treated and treated patients with chemotherapy.
dc.format
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application/pdf
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eng
dc.rights
This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 license
dc.rights
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject
Treball de fi de grau – Curs 2021-2022
dc.subject
Transcriptòmica espacial
dc.subject
Transcriptòmica de cèl·lules individuals
dc.subject
Càncer d’ovari serós d’alt grau
dc.subject
Microambient tumoral
dc.subject
Transcriptómica espacial
dc.subject
Transcriptómica de células individuales
dc.subject
Cáncer
dc.subject
Cáncer de ovario seroso de alto grado
dc.subject
Microambiente tumoral
dc.subject
Spatial transcriptomics
dc.subject
Single-cell transcriptomics
dc.subject
Cancer
dc.subject
High grade serous ovarian cancer
dc.subject
Tumor microenvironment
dc.title
Integrative analysis of single-cell and spatial transcriptomics characterizes the tumor microenvironment in HGSOC patients
dc.type
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis


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